Depende de cuál sea el nombre real del barco. Si se llama Esmeralda, puede decirse perfectamente «el (barco) Esmeralda»; otra cosa es si el nombre propio de la nave incluye el artículo (La Esmeralda), en cuyo caso podría decirse «el barco La Esmeralda» o «el La Esmeralda», aunque resulta un poco chocante el uso de los dos artículos.