Según la Ortografía de la lengua española, se escribe junto, comoquiera, cuando significa ‘sea cual sea el modo’ o ‘de cualquier manera’ (Hazlo comoquiera que puedas), o con el sentido causal de ‘dado que, puesto que’ en la locución comoquiera que (Comoquiera que estamos listos, podemos empezar).
Se escribe separado, como quiera, cuando significa ‘del modo que desee’: Le prepararemos el chuletón como quiera.