Si no se pone una coma o un punto y coma entre las distintas preguntas, el signo de interrogación de cierre, equivale a un punto, por lo que la siguiente palabra debería empezar con mayúscula. Las posibilidades son estas:

1) ¿Por obediencia? ¿Por enajenación mental? ¿Simplemente por abuso del LSD?

2) ¿Por obediencia?, ¿por enajenación mental?, ¿simplemente por abuso del LSD? (aquí pueden sustituirse las comas por punto y coma).