Es correcto. La tercera acepción de manuscrito en el diccionario académico es ‘texto original de una publicación’. Aunque en su sentido propio se restringía a aquellos que se habían escrito a mano, se ha extendido a otros tipos de originales.

Es un fenómeno parecido a pluma, que designa un instrumento para escribir, aunque no sea ya una pluma de ave.