En principio es preferible la segunda de las alternativas que da (estar como investigado), por tratarse —tal como señala el Diccionario del español jurídico de la RAE— de un sustantivo, pero no cabe tachar de incorrecto el giro estar investigado, creado por analogía con estar procesado, estar imputado, estar vigilado y otros similares.

El giro está siendo investigado puede ser adecuado cuando hay abierta una investigación, sea del tipo que sea, con independencia de la situación procesal de la persona, por lo que no es exactamente lo mismo que estar investigado.