Lo habitual es que se construya con un verbo en subjuntivo para hablar de un momento no específico: «Cuandoquiera que vayas, avísame». Sin embargo, la Nueva gramática de la lengua española indica que el indicativo es posible si se habla genéricamente y de algo que, por lo común, se repite: «Cuandoquiera que vas, siempre vas muy preparado» (es decir, ‘cada vez que vas, todas las veces que vas’).

Esto mismo se aplica a otros relativos del mismo tipo, como dondequiera (dondequiera que vas/vayas).