Como indica la ortografía académica, el sustantivo aislado iglesia solo se escribe con mayúscula inicial cuando se refiere a la institución, como en «La Iglesia católica y la sociedad civil».
Cuando forma parte del nombre de un edificio, puede escribirse con mayúscula o minúscula, según lo explicado por la Ortografía: «El funeral se celebró en la iglesia de los Sagrados Corazones».