Sí, ambos son correctos, aunque extubar es el término más utilizado en el ámbito médico. Según el Diccionario de términos médicos de la Real Academia Nacional de Medicina es ‘retirar un tubo o una cánula previamente insertados en un conducto, en un órgano hueco o en una cavidad orgánica’.

La misma obra ofrece como sinónimos desintubar y descanular, igualmente válidos, pero empleados en menor medida. Respecto a desentubar, es también una formación correcta, aunque el uso de esta palabra es escaso.

En definitiva, aunque los tres términos son válidos, el más recomendable es extubar.