Lo recomendable es acefalia, como todas las voces que terminan con el elemento compositivo -cefalia. Aunque el Diccionario panhispánico de dudas censuraba explícitamente la grafía con tilde, su uso está extendido y tanto el Diccionario de la lengua española, de publicación posterior, como el Diccionario de términos médicos, de la Real Academia Nacional de Medicina, admiten acefalía, con hiato, en especial en zonas de América Meridional, si bien la forma preferida sigue siendo sin tilde.

Respecto al significado, puede utilizarse literalmente con el sentido de ‘ausencia de cabeza’ como de forma figurada, equivalente a ‘vacío de poder’ o ‘vacante en un puesto de importancia’.