Estos sustantivos no deben confundirse porque no significan lo mismo en todos los contextos.
Abertura es la 'hendidura o espacio que rompe la continuidad de una superficie': «En la tapia había una abertura», aunque más raramente se emplea también como 'acción y efecto de abrir', sobre todo en sentido físico: «Abertura de maletero automatizada». Por su parte apertura significa 'acción de abrir lo que estaba cerrado': «Caja fuerte de apertura retardada», e 'inauguración o comienzo': «Se ha celebrado la apertura del curso».