Tanto Mercosur, solo con inicial mayúscula, como MERCOSUR son formas válidas de escribir el acrónimo de Mercado Común del Sur.
En los medios económicos es habitual leer «El acuerdo entre la UE y Mercosur ha sido uno de los temas centrales de la reunión», «¿Cuáles son los países del MERCOSUR?» o «Argentina se prepara para la convención del Mercosur».
Tal y como se explica en la Ortografía de la lengua española, es frecuente y válido que los acrónimos (siglas que pueden leerse con naturalidad en español sílaba a sílaba) construidos a partir de nombres comunes se incorporen al léxico —ovni, sida, láser— y se escriban íntegramente en minúsculas, y en el caso de aquellos que provienen de nombres propios, si tienen cinco letras o más —Unicef, Unesco, Sareb—, se escriban solo con mayúscula inicial.
Por lo tanto, los ejemplos iniciales son todos válidos.