Tanto a las afueras como en las afueras son expresiones correctas, y pueden emplearse indistintamente.
Afueras, en plural, es un sustantivo que significa ‘periferia, alrededores de una población’ y, según el Diccionario panhispánico de dudas, con verbos que no expresan movimiento puede ir precedido indistintamente por las preposiciones a y en. Las oraciones «Vive a las afueras de la ciudad» y «Vive en las afueras de la ciudad» serían, por tanto, igualmente aceptables.