No es sinónimo de acusaciones.

El término alegaciones se refiere a lo que uno dice cuando se le acusa de algo y decide demostrar su inocencia porque viene del verbo alegar que significa ‘citar, traer uno a favor de su propósito, como prueba, disculpa o defensa, algún hecho, dicho, ejemplo, etc.’

La confusión de alegaciones con acusaciones se debe a una influencia del termino inglés allegation que en español debe traducirse por aseveración, aserto o acusación. Por lo tanto, en ejemplos como «Mientras no se prueben las alegaciones en su contra, el tribunal no dictará sentencia», lo correcto sería emplear acusaciones.